Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms