Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Pacsin3Q99JB8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pacsin3Q99JB8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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