Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec3Q99J72 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms