Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Bbox1Q924Y0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbox1Q924Y0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms