Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Odf3Q920N1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Odf3Q920N1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Odf3Q920N1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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