Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms