Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms