Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fam20bQ8VCS3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam20bQ8VCS3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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