Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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