Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ssh3Q8K330 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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