Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trappc12Q8K2L8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trappc12Q8K2L8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trappc12Q8K2L8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trappc12Q8K2L8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trappc12Q8K2L8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trappc12Q8K2L8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trappc12Q8K2L8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc12Q8K2L8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms