Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0W3

Rnf208, RING finger protein 208, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf208Q8K0W3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms