Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setd1bQ8CFT2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd1bQ8CFT2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms