Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcinQ8CDE2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms