Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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