Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms