Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrip1Q8CBD1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms