Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NkrfQ8BY02 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms