Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam53cQ8BXQ8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms