Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms