Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms