Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChfrQ810L3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms