Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn34b3Q80ZS5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn34b3Q80ZS5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn34b3Q80ZS5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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