Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Zbed4Q80WQ9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Zbed4Q80WQ9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Zbed4Q80WQ9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Zbed4Q80WQ9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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