Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp8Q80U87 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp8Q80U87 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp8Q80U87 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp8Q80U87 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp8Q80U87 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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