Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc2bQ7TPM1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc2bQ7TPM1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms