Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms