Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms