Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb3Q6XAS4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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