Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtifQ6PEE2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms