Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfrlQ6PE55 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms