Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trak1Q6PD31 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms