Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx4Q6P1D7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx4Q6P1D7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms