Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca2Q6DIC0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms