Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms