Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms