Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms