Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sf1Q64213 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sf1Q64213 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sf1Q64213 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sf1Q64213 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sf1Q64213 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sf1Q64213 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sf1Q64213 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sf1Q64213 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sf1Q64213 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sf1Q64213 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sf1Q64213 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sf1Q64213 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sf1Q64213 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sf1Q64213 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sf1Q64213 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sf1Q64213 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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