Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PatjQ63ZW7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PatjQ63ZW7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms