Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf260Q62513 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms