Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrmsQ62270 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrmsQ62270 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrmsQ62270 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrmsQ62270 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrmsQ62270 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrmsQ62270 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrmsQ62270 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SrmsQ62270 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SrmsQ62270 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrmsQ62270 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms