Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sall3Q62255 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms