Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ttf1Q62187 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ttf1Q62187 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ttf1Q62187 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Ttf1Q62187 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Ttf1Q62187 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttf1Q62187 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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