Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
AtrxQ61687 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrxQ61687 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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