Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms