Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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