Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms