Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms