Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SkiQ60698 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SkiQ60698 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms