Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Utp20Q5XG71 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp20Q5XG71 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms